O IPEX tem como missão desenvolver e subsidiar pesquisas com comprometimento e respeito, acerca dos problemas socioespaciais e ambientais no território amazônico, bem como, expandindo suas ações para outras regiões, visando assim, o bem-estar social  e referência a partir das ações com o envolvimento e participação das comunidades,  intercambiando experiências e conhecimentos sobre o território. Dessa forma, firma-se o compromisso de respeitar, produzir e incentivar informações e conhecimentos nas mais diferentes frentes de atuação, construindo espaços flexíveis e construtivos a partir  das relações sociais vivenciadas no cotidiano.